1974 İstanbul'Fatih doğumlu Ebru Gündeş,ilk öğrenimini Ankara Ulubatlı Hasan İlköğretim Okulu'nda,orta öğrenimini İstanbul Sefaköy Lisesi'nde okudu. Maddi imkansızlıklar nedeniyle liseden sonra okuyamadı. Konfeksiyon atölyesinde çalışarak iş hayatına atıldı.
Ebru Gündeş'in ses yeteneğini ilk keşfeden annesi Müjgan Ayvazoğlugil oldu. 1989 yılında bir aile dostu, sesinin güzelliğini görerek onu ve annesini Raks Neşe Müzik'in ortağı Neşe Demirkanat ile tanıştırdı. Ebru Gündeş'in sesini dinlediğinde büyülenen Neşe Demirkanat, onu prodüktör Koral Sarıtaş ve Selçuk Tekay ile çalışmasını sağladı.
1991 yılında Emel Sayın'ın vokalistliğini yaptı.
1993 yılında ilk albümü Tanrı Misafiri müzik piyasasında büyük ilgi gördü. Henüz 19 yaşında olmasına karşın güçlü sesi dikkat çekti. İlk albümünde 1 milyon 250 bin satış rakamı elde etti.
1999 yılında çıkardığı Dön Ne Olur adlı albümünün tanıtımı sırasında basın mensupları karşısında Aralık 1999'da beyin kanaması geçirdi. Bu olay üzerine uzunca bir süre hayranlarından uzak kalan Gündeş’in bu albümü 1 milyondan fazla sattı.
Aynı albümde yer alan Sen Allah'ın Bir Lütfusun şarkısının klibinde Fenerbahçe'nin Nijeryalı futbolcusu Uche Okechukwu ile rol aldı.
Bir yıllık bir dinlenme döneminin ardından ilk konserini Mart 2000 tarihinde Bostancı Gösteri Merkezi'nde verdi ve konserin tüm gelirini Haydarpaşa Numune Eğitim ve Araştırma Vakfı Hastanesi Reanimasyon Kliniği'ne bağışladı.
2013 yılından itibaren O Ses Türkiye adlı müzik yarışma programında jüri üyeliği yaptı.
1990-1993 yılları arasında Hamdi Vardar, 2002-2003 yılları arasında avukat Ömer Durak, 2010-2021 yılları arasında iş insanı Rıza Sarraf ile evli kaldı.Gündeşin Rıza Sarraf ile evliliğinden Alara adlı bir kızı dünyaya geldi. ABD'nin İran yaptırımlarını ihlal suçlamasıyla 2016'da tatil için gittiği Miami'de tutuklanan Rıza Sarraf, serbest bırakıldıktan sonra Türkiye'ye geri dönmedi. Mayıs 2021'de, Rıza Sarraf'ın kendisini aldattığı iddiasıyla Bodrum Aile Mahkemesi'nde dava açan Ebru Gündeş, 11 yıllık evliliğini sona erdirerek anlaşmalı olarak boşandı.
Bir ara Iraklı işadamı Rassan Khoshnaw ile birlikte gözlerden uzak bir ilişki yaşayan Ebru Gündeş, günümüzde dördüncü eşi iş insanı Murat Osman Özdemir ile Şubat 2024'te Dubai'de evlenmiştir. Daha önce iki evlilik yapan Murat Özdemir,en son evliliğini 2002 Best Model Güzeli Selin Kabaklı ile yaptı. İlk evliliğinden 2 Selin Kabaklı ile evliliğinden de bir çocuğu bulunmaktadır.
